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日本政策金融公庫の事業承継融資との違い|補助金と融資の使い分け

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事業承継・M&A補助金と日本公庫の事業承継融資の違い 2026年版

この記事の結論

事業承継・M&A補助金と日本公庫の事業承継融資は、目的も対象経費も違う制度です。事業承継・M&A補助金は補助率1/3〜2/3、電子申請はJグランツのみ、16次公募の申請締切は2026年11月6日です。同じ経費に両方を受けることはできないため、どちらで申請するかを先に決めてください。

日本政策金融公庫は事業承継に関連する融資メニューを扱っていますが、融資は借入であり返済が必要です。一方、事業承継・M&A補助金は交付決定を受けた事業を実施し実績報告を経て確定した額が支払われる補助金で、返済は原則不要です(賃上げ要件未達等の場合を除く)。日本政策金融公庫の融資の金利・要件等の詳細な数値は本ファクトパックでは一次資料を確認できていないため、公式サイトでご確認ください。交付決定日以降の契約・発注・支払いだけが補助対象になるため、事業着手のタイミングと資金繰りの計画をあわせて考えておく必要があります。資金繰りの立て替えに融資を使い、後日補助金で精算する、という組み合わせ方をする事業者もいます。

事業承継・M&A補助金と日本公庫の事業承継融資の比較表

事業承継・M&A補助金と日本公庫の事業承継融資を項目ごとに並べました。比較先の値は公式で確認できたものだけを載せています。

項目事業承継・M&A補助金日本公庫の事業承継融資
制度の性質補助金(返済不要が原則)融資(借入・返済が必要、公式サイトで確認)
受け取り方精算払い(事業完了・実績報告後に確定額を交付)融資実行時にまとまった資金を受け取る(公式サイトで確認)
対象になる経費謝金・旅費・外注費・委託費・システム利用料・保険料・設備費等(枠による)事業承継に必要な運転資金・設備資金全般(公式サイトで確認)
審査の観点取組の目的・必要性、実現可能性、収益性、継続性(外部有識者の書面審査)財務状況・返済能力等(公式サイトで確認)
利用の前提GビズIDプライムアカウント、認定経営革新等支援機関の確認書公式サイトで確認
自己負担の発生補助対象経費の1/2〜2/3が補助され、残りは自己負担融資であるため元本に加え金利負担が発生(公式サイトで確認)
資金を受け取るタイミング事業完了後(精算払い)融資実行時(事業実施前に資金化できる場合が多いと考えられます)
組み合わせ方補助対象経費を立て替える資金として融資を利用する事業者もいる補助金の交付までのつなぎ資金として活用されるケースがある

事業承継・M&A補助金の4つの申請枠

事業承継・M&A補助金は4つの枠に分かれており、承継の相手と費用の時期で使う枠が変わります。日本公庫の事業承継融資と比べる前に、自社がどの枠に当てはまるかを確認してください。

申請枠補助上限補助率主な対象
事業承継促進枠上限800万〜1,000万円1/3〜2/3親族内承継・従業員承継など、既存の事業を引き継いだ後の設備投資や新たな取り組みを支援する枠です。
専門家活用枠上限600万〜800万円(要件を満たす場合は最大2,000万円)1/3〜2/3第三者へのM&A(譲渡・譲受)に伴う専門家への費用を支援する枠です。買い手側・売り手側それぞれの類型があります。
PMI推進枠公募要領で確認1/3〜2/3M&Aの成立後に行う経営統合(PMI)の取り組みを支援する枠です。補助上限は公募回ごとに公募要領で確認してください。
廃業・再チャレンジ枠原則300万円1/3〜2/3事業の廃業に伴う費用や、廃業後の再チャレンジを支援する枠です。他の枠と併用する類型もあります。
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どちらで申請すべきか

どちらの制度で申請するかは、補助したい費用が何かで決まります。

事業承継・M&A補助金が向くケース

  • 後継者への引継ぎやM&Aにかかる専門家費用の一部を補助でまかないたい場合
  • 返済負担を増やさずに承継関連の取り組みを進めたい場合
  • 交付決定後の実費を精算払いで受け取る形でよい場合

日本公庫の事業承継融資が向くケース

  • 補助金の交付(事業完了後)を待たずに、先に資金が必要な場合(公式サイトで確認)
  • 補助対象外の経費(運転資金等)もまとめて調達したい場合(公式サイトで確認)
  • 補助金の自己負担分や、補助対象経費の立て替え資金を確保したい場合

併用・重複の可否

補助金と融資は制度としての性質が異なり、一般的には排他的な関係ではありません。事業承継・M&A補助金は交付決定後の契約・発注・支払いが対象で、精算払いのため資金化は事業完了後になります。そのため、日本政策金融公庫等の融資で先に資金を確保し、事業完了後に補助金を受け取って返済に充てる、という組み合わせ方をする事業者もいます。日本政策金融公庫側の商品詳細・要件は本ファクトパックでは未確認のため、必ず公式サイトまたは公庫窓口で確認してください。

同一経費の重複は不可

同じ経費に複数の補助金を重ねて受けることはできません。経費を分けて申請できるかどうかは、それぞれの事務局に事前に確認してください。

電子申請はJグランツのみで受け付けられ、GビズIDプライムのアカウントが必要です。

制度の全体像と申請の手順は、以下の記事で詳しく解説しています。

出典・参考リンク

本ページの制度情報は以下の公式情報にもとづいています(2026-09-10 確認)。補助上限・対象経費・締切は公募回ごとに変わるため、申請前に必ず各制度の公式サイトでご確認ください。

よくある質問(FAQ)

A制度としては別立てで、一般的に排他的な関係ではありません。補助金は事業完了後の精算払いのため、先に必要な資金を融資でまかない、後日補助金を受け取るという組み合わせ方をする事業者もいます。詳細は日本公庫の窓口で確認してください。
A制度上、補助金は補助対象経費の1/2〜2/3(枠により異なる)が交付され、残りは自己負担になります。この自己負担分の資金調達に融資を利用すること自体は一般的に問題ないと考えられますが、融資の条件は公庫窓口で確認してください。
A本ファクトパックでは日本政策金融公庫の事業承継関連融資の金利・要件等を一次資料で確認できていません。日本政策金融公庫の公式サイトまたは窓口で最新の情報を確認してください。
A本補助金の審査は取組の目的・必要性、実現可能性、収益性、継続性を書面審査するもので、融資の有無自体が直接の審査項目として明記されているわけではありません。詳しくは公募要領・事務局に確認してください。
A電子申請はJグランツのみで受け付けられ、GビズIDプライムのアカウントが必要です。アカウントの発行には時間がかかるため、16次公募の申請締切(2026年11月6日)から逆算して早めに取得してください。
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本記事の監修

齊木祐介(株式会社ASI 代表取締役)

AI・ロボティクスの導入支援、補助金・助成金の活用支援、専門メディアの運営など複数事業を統括。実務で得た知見をもとに、本サイトの情報を監修しています(運営:株式会社ASI)。

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