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京都市の事業承継・M&A補助金2026|対象と申請

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京都市の事業承継・M&A補助金 2026年最新情報

この記事の結論

京都市で事業承継・M&A補助金を使うなら、承継の相手(親族・従業員・第三者)と費用の時期で申請する枠が決まります。補助率は1/3〜2/3、電子申請はJグランツのみ、16次公募の申請締切は2026年11月6日です。まずは京都府の事業承継・引継ぎ支援センターで無料相談してください。

京都市の伝統産業・ものづくりで事業を残すには、技術と経営の引継ぎを併せて考えましょう。観光・宿泊では店舗の運営体制も整理しておきたい項目です。大学・研究に関わる事業の場合は申請主体に注意が必要です。学校法人は本補助金の対象外です。身近な相談先は京都商工会議所です。事業承継・M&A補助金は、親族内・従業員承継なら事業承継促進枠を検討します。第三者承継は専門家活用枠、統合はPMI推進枠が検討対象です。承継に伴う一部廃業では、廃業・再チャレンジ枠の併用も確認します。16次公募要領は公開済みです。2026年9月11日時点で申請受付は始まっていません。受付予定は2026年10月2日〜11月6日17:00です。

県全体の情報

京都府全体の窓口一覧と制度の使い方は「京都府の事業承継・M&A補助金ガイド」もあわせてご確認ください。

申請枠補助上限補助率主な対象
事業承継促進枠上限800万〜1,000万円1/3〜2/3親族内承継・従業員承継など、既存の事業を引き継いだ後の設備投資や新たな取り組みを支援する枠です。
専門家活用枠上限600万〜800万円(要件を満たす場合は最大2,000万円)1/3〜2/3第三者へのM&A(譲渡・譲受)に伴う専門家への費用を支援する枠です。買い手側・売り手側それぞれの類型があります。
PMI推進枠公募要領で確認1/3〜2/3M&Aの成立後に行う経営統合(PMI)の取り組みを支援する枠です。補助上限は公募回ごとに公募要領で確認してください。
廃業・再チャレンジ枠原則300万円1/3〜2/3事業の廃業に伴う費用や、廃業後の再チャレンジを支援する枠です。他の枠と併用する類型もあります。

京都市の相談窓口

京都市の事業者が事業承継・M&Aの相談に使える窓口です。事業承継・M&A補助金の申請前に、承継の型と使える枠をここで確認しておくと手戻りがありません。

窓口京都商工会議所
種別商工会議所
公式サイトhttps://www.kyo.or.jp/kyoto/

京都府の事業承継・引継ぎ支援センター

国が全国の都道府県に設置している公的な相談窓口です。親族内承継の進め方から第三者への引継ぎ(M&A)の相手探しまで無料で相談できます。

事業承継・引継ぎ支援センターを探す 事業承継・引継ぎポータルサイト(中小企業庁)

4つの申請枠と京都市での使い分け

4つの枠は「誰に引き継ぐか」「いつの費用か」で分かれます。承継前後の設備投資なら事業承継促進枠、M&Aの専門家費用なら専門家活用枠、成立後の経営統合ならPMI推進枠、たたむ費用なら廃業・再チャレンジ枠です。

専門家活用枠を使う前に

専門家活用枠では、M&A支援機関登録制度に登録された事業者(登録M&A支援機関)への費用であることが要件になる場合があります。契約前に登録の有無を公式の登録リストで確認してください。

事業承継促進枠を京都市で使う場合

補助上限:上限800万〜1,000万円 補助率:1/3〜2/3

親族内承継・従業員承継など、既存の事業を引き継いだ後の設備投資や新たな取り組みを支援する枠です。

対象経費の範囲と必要書類は公募回ごとに変わります。申請前に公募要領で確認し、判断に迷う場合は京都府の事業承継・引継ぎ支援センターに相談してください。

専門家活用枠を京都市で使う場合

補助上限:上限600万〜800万円(要件を満たす場合は最大2,000万円) 補助率:1/3〜2/3

第三者へのM&A(譲渡・譲受)に伴う専門家への費用を支援する枠です。買い手側・売り手側それぞれの類型があります。

対象経費の範囲と必要書類は公募回ごとに変わります。申請前に公募要領で確認し、判断に迷う場合は京都府の事業承継・引継ぎ支援センターに相談してください。

PMI推進枠を京都市で使う場合

補助上限:公募要領で確認 補助率:1/3〜2/3

M&Aの成立後に行う経営統合(PMI)の取り組みを支援する枠です。補助上限は公募回ごとに公募要領で確認してください。

対象経費の範囲と必要書類は公募回ごとに変わります。申請前に公募要領で確認し、判断に迷う場合は京都府の事業承継・引継ぎ支援センターに相談してください。

廃業・再チャレンジ枠を京都市で使う場合

補助上限:原則300万円 補助率:1/3〜2/3

事業の廃業に伴う費用や、廃業後の再チャレンジを支援する枠です。他の枠と併用する類型もあります。

対象経費の範囲と必要書類は公募回ごとに変わります。申請前に公募要領で確認し、判断に迷う場合は京都府の事業承継・引継ぎ支援センターに相談してください。

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京都市の業種別 事業承継のポイント

京都市の主要産業(伝統産業・ものづくり・観光・宿泊・大学・研究)で、事業承継・M&Aのときに問題になりやすい点をまとめます。

京都市の伝統産業・ものづくり:事業承継で使える枠

京都市の伝統産業・ものづくりで承継を検討する際は、製造の技能と取引先との関係を整理しましょう。後継者が続ける事業の内容を明確にして、承継に合わせた設備投資の必要性を考えます。親族内・従業員承継なら、事業承継促進枠の要件を確認します。経営権と所有権の両方を移す計画が必要です。M&Aによる第三者承継は、この枠の対象外です。投資の目的、実現可能性、収益性を説明できるよう準備しましょう。契約や発注は交付決定後に行うことが原則です。採択と交付決定は別の手続きです。

京都市の観光・宿泊:事業承継で使える枠

京都市の観光・宿泊で承継を検討する際は、予約管理、施設の運営、顧客対応の引継ぎを整理しましょう。第三者へ譲る場合は、事業全体の範囲を明確にして専門家に相談することが大切です。第三者への譲渡・譲受を伴うM&Aでは、専門家活用枠を検討します。FA・仲介業務の委託費は、登録M&A支援機関による支援に限り対象です。相見積りも登録業者から取り、価格を比較する必要があります。最低価格を提示していない業者を選ぶと補助対象外です。契約時期や経費の区分も公募要領で確認しましょう。

京都市の大学・研究:事業承継で使える枠

京都市の大学・研究で承継を検討する際は、学校法人や一般社団法人、一般財団法人は対象外です。研究に関わる企業の場合も、申請主体の法人形態と規模を確認してから計画を検討します。M&A後の統合では、PMI推進枠の要件を確認します。計画策定の専門家費用はPMI専門家活用類型で検討します。設備やシステムの統合投資は、事業統合投資類型で検討する内容です。仲介手数料やDD費用は事業統合投資類型の対象外です。対象経費を分け、交付決定後の契約や発注を前提に計画しましょう。

京都市独自の中小企業支援制度(公式サイトで確認済み)

京都市が実施している中小企業向けの支援制度のうち、公式サイトで内容を確認できたものです。事業承継・M&A補助金とは別制度ですが、承継後の投資に使えることがあります。

制度名補助額補助率対象担当・出典
京都市伝統産業未来構築事業補助金
受付状況:令和8年度受付中(募集期間:令和8年4月1日〜同年5月15日、事業期間:令和8年4月1日〜令和9年3月31日)
上限100万円(「1.販路開拓・拡大に資する事業」「2.新商品開発を含む商品力の向上に繋がる事業」)、上限200万円(「3.後継者・技術者の確保・育成又は技術継承に資する事業」「4.確保が困難な道具・部品対策」「5.海外展開に繋がる事業」)補助対象経費の1/2以内産地組合等の伝統産業関係団体又は本市伝統産業に従事する方を含むグループ(3名以上)による販路開拓・新商品開発・後継者育成・道具部品対策・海外展開等の取組産業観光局クリエイティブ産業振興室
075-222-3337
公式
2026-09-10 確認
京都市賃上げ環境整備支援事業
受付状況:事前エントリー受付終了(令和8年5月20日〜同年7月17日、予算額に達し次第終了)
一般枠:上限200万円(下限50万円)、小規模企業者枠:上限100万円(下限20万円)一般枠は補助対象経費の2/3以内、小規模企業者枠は4/5以内京都市内に主たる事業所を有する中小企業・小規模企業者、個人事業主、組合等が行う省力化・生産性向上に資する設備投資・機器購入(例:製造業の協働ロボット、飲食業の自動食器洗浄機・自動調理器等)。実績報告時の給与支給総額が令和7年12月比1.9%以上上昇していることが賃上げ要件産業観光局地域企業振興室(京都市賃上げ環境整備支援事業事務局)
075-222-3329(事務局0570-075-820)
公式
2026-09-10 確認
京都市伝統産業設備改修等補助制度
受付状況:令和8年度受付中(募集期間:令和8年4月1日〜同年5月29日、事業期間:令和8年4月1日〜令和9年3月31日)
上限200万円老朽化・法令改正等による設備の改修・更新は補助対象経費の1/3以内、新規雇用や新商品開発につながる設備の新設は1/2以内伝統産業製品等を市内で製造する中小企業者又は組合が行う、原則1件30万円(税抜)以上の設備の改修・更新・新設(リース・レンタルは対象外)産業観光局クリエイティブ産業振興室
075-222-3337
公式
2026-09-10 確認
AI・ロボティクス・セキュリティ等導入促進支援プラットフォーム事業
受付状況:令和8年度実施予定(募集時期未定。詳細はASTEM(https://www.astem.or.jp/)に掲載予定)
上限200万円補助対象経費の2/3以内京都市内に事業所を有する中小企業等が行う、AI・ロボティクスの選定・活用方法の検討から疑似的環境での実証実験に必要なIoTセンサー等の機器購入費・ロボット等の経費の一部(概念実証(PoC)支援)産業観光局スタートアップ・産学連携推進室
公式
2026-09-10 確認
京都市中小事業者の高効率機器導入促進事業補助金
受付状況:令和8年度募集終了見込み(募集期間:令和8年6月中旬〜同年8月末(予定)。交付決定日〜令和9年1月31日(予定))
上限200万円(下限50万円)補助対象経費の1/2京都市地球温暖化対策条例に基づく準特定事業者(市内に1,000㎡以上の事業用建築物を所有する者)及び中小企業等が行う高効率空調機器・高機能換気設備・高効率照明機器・高効率給湯機器への更新環境政策局地球温暖化対策室
公式
2026-09-10 確認
令和8年度 ものづくり産業AI活用支援事業
受付状況:募集中(令和8年8月14日〜同年9月25日17時必着。補助期間は交付決定日〜令和9年2月28日)
1件あたり上限500万円補助対象経費の1/2以内京都府内に製品開発・生産・営業等の事業活動拠点を有し、京都府AIサポートチームの伴走支援を踏まえてAI技術を活用した製品・サービス開発(AIを活用したロボットの設計開発、デジタルツイン技術によるFA化、サイバーセキュリティ等)に取り組む中小企業者及びスタートアップ企業公益財団法人京都産業21 イノベーション統括本部イノベーション推進室(京都府事業の実施団体)
075-315-8677
公式
2026-09-10 確認
自立的地域活用型再エネ導入等計画に基づく再生可能エネルギー設備等導入補助金(京都府再生可能エネルギーの導入等の促進に関する条例)
受付状況:計画認定期間:令和8年4月1日〜令和13年3月31日(補助金は予算の範囲内で実施のため、計画認定を受けても交付を確約するものではない)
太陽光発電を導入する場合は上限250万円(7万円/kW、設計・施工を京都再エネコンシェルジュが行う場合は10万円/kW)。太陽光発電以外の再エネ設備を導入する場合は上限400万円(再エネ設備・蓄電池・EMSの3種を導入する場合は補助率1/2に増額)太陽光発電以外は補助対象経費の1/3(3種同時導入時は1/2)。太陽光発電はkW単価制。別途、法人事業税・個人事業税の減免(設備取得価格の1/3、上限1,000万円)あり京都府内で条例に基づく『自立的地域活用型再エネ導入等計画』の認定を受けた中小企業者等が導入する太陽光発電・蓄電池・EMS等の再生可能エネルギー設備等(要事前の計画認定)総合政策環境部脱炭素社会推進課
075-414-4708
公式
2026-09-10 確認

国の補助金と自治体の制度は、同一の経費に重ねて受けることはできません。経費を分けて申請できるかどうかは、それぞれの窓口に事前に確認してください。

京都市で申請するときのコツ

京都市で申請する事業者からよく出る論点をまとめました。

  1. 京都府事業承継・引継ぎ支援センターへ早期に相談しましょう。後継者の有無や承継方法が未定でも、事業と経営の課題を整理して伝えることが出発点です。
  2. 専門家活用枠のFA・仲介業務の委託費は、M&A支援機関登録制度の登録業者による支援に限り対象です。依頼前に登録状況を確認しましょう。
  3. 16次公募の申請受付は2026年10月2日〜11月6日17:00の予定です。公募要領は公開済みですが、2026年9月11日時点では受付前です。
  4. 電子申請はJグランツのみです。GビズIDプライムを準備しましょう。取得は1〜2週間、混雑時は3週間程度が目安のため、早めに手続きを進めます。

申請前に必ず確認すること

  • 電子申請はJグランツのみです。GビズIDプライムのアカウントを先に取得してください。
  • 交付決定の前に契約・発注した費用は対象外です。
  • 16次公募の申請締切は2026年11月6日です。補助上限と対象経費は公募回ごとに変わるため、最新の公募要領で確認してください。

京都府全体の事業承継・M&A補助金情報

京都府全体の窓口一覧、県独自の上乗せ制度、採択の状況は都道府県別ガイドで解説しています。

京都市の主要業種別ガイド

京都市の主要産業(伝統産業・ものづくり・観光・宿泊・大学・研究)向けの事業承継ガイドです。

京都府の他の市区町村ガイド

京都府内の他の市区町村のガイドもあわせてご覧ください。

制度の全体像と申請の手順は、以下の記事で詳しく解説しています。

出典・参考リンク

本ページの制度情報は以下の公式情報にもとづいています(2026-09-10 確認)。補助上限・対象経費・締切は公募回ごとに変わるため、申請前に必ず公式の公募要領をご確認ください。

よくある質問(FAQ)

A京都商工会議所が相談先です。親族内承継や第三者承継は、京都府事業承継・引継ぎ支援センターにも早めに相談できます。公式サイトはhttps://www.kyoto-shoukei.go.jp/です。後継者の状況と引き継ぐ事業を整理しておきましょう。
A事業承継促進枠の通常の補助上限は800万円です。補助率は1/2以内、小規模事業者等は2/3以内です。賃上げ要件を達成すると上限1,000万円となります。800万円超の部分は一律1/2以内です。親族内・従業員承継が対象で、M&Aは対象外です。賃上げ要件が未達の場合は、引き上げ額の返還が求められます。
A専門家活用枠の通常の買い手・売り手支援類型は上限600万円です。DD費用は200万円を上乗せできます。買い手は2/3以内、売り手は条件により1/2または2/3以内です。小規模売り手支援類型は上限450万円、2/3以内です。買い手支援類型の100億企業特例は上限2,000万円です。同特例の補助率は1,000万円以下が1/2、超える部分が1/3です。各類型の対象要件を確認します。
APMI推進枠のPMI専門家活用類型は上限150万円、1/2以内です。事業統合投資類型は上限800万円です。補助率は1/2以内、小規模事業者等は2/3以内です。賃上げ要件達成で上限1,000万円となります。800万円超の部分は一律1/2以内です。廃業・再チャレンジ枠の単独申請は上限300万円、2/3以内です。M&Aで譲り渡せなかった事業の廃業と再チャレンジなど、対象要件を確認する必要があります。
A京都商工会議所が入口になります。京都府の事業承継・引継ぎ支援センターでは、親族内承継の進め方から第三者への引継ぎまで無料で相談できます。
A電子申請はJグランツのみで受け付けられ、GビズIDプライムのアカウントが必要です。アカウントの発行には時間がかかるため、16次公募の申請締切(2026年11月6日)から逆算して早めに取得してください。
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本記事の監修

齊木祐介(株式会社ASI 代表取締役)

AI・ロボティクスの導入支援、補助金・助成金の活用支援、専門メディアの運営など複数事業を統括。実務で得た知見をもとに、本サイトの情報を監修しています(運営:株式会社ASI)。

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