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運送業の事業承継・M&A補助金2026|対象経費と許可

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運送業の事業承継・M&A補助金 2026年ガイド

この記事の結論

運送業の事業承継・M&Aでは、承継の相手と費用の時期で使う枠が変わります。補助率は1/3〜2/3、電子申請はJグランツのみ、16次公募の申請締切は2026年11月6日です。対象経費の区分は公募要領の表記どおりに整理してから申請してください。

運送業はドライバー不足や燃料費の高騰を背景に、事業承継やM&Aによる経営統合が増えている業種です。事業承継・M&A補助金には、親族内・従業員承継を支援する事業承継促進枠、運送事業者同士のM&Aを支援する専門家活用枠、統合後の配車・動態管理システムの統合を支援するPMI推進枠、廃業に伴う費用を補う廃業・再チャレンジ枠の4つがあります。貨物自動車運送事業の許可の承継可否や手続きは運輸支局等の審査事項であり、本補助金の審査対象ではないため、要件や手続きの詳細は専門家に確認することが必要です。本ページでは、補助金制度としての対象経費と申請の流れを中心に解説します。書面審査では取組の必要性・実現可能性・収益性・継続性が着眼点とされており、車両やドライバーの引継ぎ計画を具体的に示すことが重要になります。

申請枠補助上限補助率主な対象
事業承継促進枠上限800万〜1,000万円1/3〜2/3親族内承継・従業員承継など、既存の事業を引き継いだ後の設備投資や新たな取り組みを支援する枠です。
専門家活用枠上限600万〜800万円(要件を満たす場合は最大2,000万円)1/3〜2/3第三者へのM&A(譲渡・譲受)に伴う専門家への費用を支援する枠です。買い手側・売り手側それぞれの類型があります。
PMI推進枠公募要領で確認1/3〜2/3M&Aの成立後に行う経営統合(PMI)の取り組みを支援する枠です。補助上限は公募回ごとに公募要領で確認してください。
廃業・再チャレンジ枠原則300万円1/3〜2/3事業の廃業に伴う費用や、廃業後の再チャレンジを支援する枠です。他の枠と併用する類型もあります。

運送業で使える対象経費と申請枠

運送業の事業承継・M&Aで実際に相談の多い対象経費と、その使い方です。区分名は公募要領の表記に合わせています。金額は公募回ごとに変わるため、最新の公募要領で確認してください。

事業承継促進枠:運送業での使い方

運送会社の代表が、長年勤務した運行管理者や子に経営権と株式を引き継ぐ場面

審査で効く理由

承継予定者の実務経験(役員・雇用3年以上等)の要件を満たすことを示しやすいため

専門家活用枠(買い手支援類型):運送業での使い方

ドライバー不足に悩む運送会社を同業他社が譲り受け、車両・許可・ドライバーを引き継いで輸送力を拡大する場面

審査で効く理由

経営資源(車両・許可・ドライバー)の引継ぎを具体的に説明でき、DD等の専門家費用の必要性を示しやすいため

DD費用:運送業での使い方

譲り受ける運送会社の車両整備状況や運行実績、労務状況(労働時間管理等)を専門家に調査してもらう場面

審査で効く理由

買い手支援類型ではDD実施が実質的に必須とされ、取組の実現可能性を裏付ける材料になるため

委託費:運送業での使い方

運送会社の譲渡先探しや条件交渉を登録M&A支援機関のFAに依頼する場面

審査で効く理由

登録支援機関への支払いのみが対象経費となるため、専門性の高い交渉の必要性を説明しやすいため

PMI推進枠(事業統合投資類型):運送業での使い方

譲り受けた運送会社の配車管理システムや動態管理システムを自社のものに統合する場面

審査で効く理由

経営統合効果を高める投資として位置づけやすいため

運送業の事業計画で書くべき観点

運送業で審査を通す事業計画には、次の観点を数字と根拠つきで書き込んでください。

  1. 貨物自動車運送事業の許可の承継可否や必要な手続きは、本補助金の申請要件とは別に運輸支局・専門家に確認したうえで事業計画に反映する。
  2. 承継予定者(運行管理者等)の勤務年数・実務経験を具体的に書く。
  3. 車両・許可・ドライバーの引継ぎ計画と、安全管理体制を維持する方針を事業計画に明記する。
  4. 承継後5年間の付加価値額の伸び率3%/年を、稼働率や燃料費対策の計画とあわせて示す。
  5. 賃上げ要件を満たす場合は、ドライバーの処遇改善計画と表明状況を記載する。
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運送業で対象外になりやすい経費・不備

運送業の申請で対象外と判断されやすい経費・書類の不備です。事前に潰しておくと差し戻しを避けられます。

つまずきやすい点

  • 貨物自動車運送事業の許可そのものの承継可否や手続きは公募要領の範囲外であり、運輸支局・専門家への別途確認が必要になる。
  • 交付決定前に車両や配車システムを発注・契約すると対象外になる。
  • 車両や営業所(物品・不動産等)のみを保有する事業の譲渡は実質的な事業承継と認められない場合がある。
  • 未登録のFA・仲介業者への委託費は対象外になる。相見積りで最低価格を提示していない業者を選んだ場合も対象外。

共通の注意点

交付決定の前に契約・発注した費用は対象外です。見積の取得までは進めて構いませんが、契約は交付決定を待ってください。

専門家活用枠では、M&A支援機関登録制度に登録された事業者(登録M&A支援機関)への費用であることが要件になる場合があります。契約前に登録の有無を公式の登録リストで確認してください。

運送業の申請前チェックリスト

運送業で申請するときに揃えるものです。書類の不足は差し戻しの最大の原因です。

申請前チェックリスト

  • 直近3期分の決算書・確定申告書
  • 貨物自動車運送事業許可証・車両台帳
  • 承継予定者(運行管理者等)の勤務実績を確認できる資料
  • 認定経営革新等支援機関による確認書
  • GビズIDプライムアカウント
  • 対象経費の見積書(システム・委託費・保険料等、M&A時は登録M&A支援機関からの見積り)

GビズIDプライムは最初に取得する

電子申請はJグランツのみで受け付けられ、GビズIDプライムのアカウントが必要です。アカウントの発行には時間がかかるため、16次公募の申請締切(2026年11月6日)から逆算して最初に手続きしてください。

運送業の申請の流れ

運送業が事業承継・M&A補助金を申請するときの一般的な流れです。詳細は公募回ごとの公募要領に従ってください。

  1. 事業承継・引継ぎ支援センターや顧問税理士に相談し、承継の型(親族内・従業員・第三者M&A・廃業)を固める
  2. 承継の型と費用の時期から、4つの枠のどれで申請するかを決める
  3. GビズIDプライムのアカウントを取得する
  4. 公募要領を読み、対象経費の区分ごとに見積を取得する
  5. 事業計画・必要書類を作成し、Jグランツから電子申請する
  6. 採択・交付決定を受けてから契約・発注する
  7. 事業を実施し、実績報告書を提出して補助金を受け取る

直近の採択実績

14次公募では申請512件に対して311件が採択され、採択率は60.7%でした(2026年5月15日発表)。

運送業でよく使われる枠と経費については、それぞれの解説ページもあわせてご覧ください。

制度の全体像と申請の手順は、以下の記事で詳しく解説しています。

出典・参考リンク

本ページの制度情報は以下の公式情報にもとづいています(2026-09-10 確認)。補助上限・対象経費・締切は公募回ごとに変わるため、申請前に必ず公式の公募要領をご確認ください。

よくある質問(FAQ)

A貨物自動車運送事業の許可の承継手続きは補助金制度とは別に、運輸支局等の審査を要します。要件や手続きは個別事情で異なるため専門家にご確認ください。
A承継予定者が対象会社の役員として3年以上、または継続3年以上雇用され業務に従事していれば、従業員承継として事業承継促進枠の対象です。
A専門家活用枠(買い手支援類型)で謝金・旅費・外注費・委託費・システム利用料・保険料・DD費用等が対象になります。
Aファイナンスリースの解約に伴う解約金・違約金は対象外です。
A承継・M&Aに伴い事業の一部を廃業する場合、廃業・再チャレンジ枠(併用)として主枠に上乗せ申請できます。
A電子申請はJグランツのみで受け付けられ、GビズIDプライムのアカウントが必要です。アカウントの発行には時間がかかるため、16次公募の申請締切(2026年11月6日)から逆算して早めに取得してください。
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本記事の監修

齊木祐介(株式会社ASI 代表取締役)

AI・ロボティクスの導入支援、補助金・助成金の活用支援、専門メディアの運営など複数事業を統括。実務で得た知見をもとに、本サイトの情報を監修しています(運営:株式会社ASI)。

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補助金は申請書類の作成や事業計画の策定に専門知識が必要です。採択率を高めたい方は、申請代行・申請サポートの専門家への相談も有効です。

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